在企业的日常经营过程中，会收到各种各样的发票，对于一般纳税人来说，增值税专用发票是可以进行进项抵扣的，这会在很大程度上减少企业所需要缴纳的税款。但在实际操作中，企业可能会遇到增值税扣税凭证异常的情况，无法进行抵扣。
异常凭证定义
异常增值税扣税凭证，即是异常凭证。
走逃（失联）企业在存续经营期间发生下列情形之一的，所对应属期开具的增值税专用发票列入异常凭证范围。
1.商贸企业购进、销售货物名称严重背离的；生产企业无实际生产加工能力且无委托加工，或生产能耗与销售情况严重不符，或购进货物并不能直接生产其销售的货物且无委托加工的。
2.直接走逃失踪不纳税申报，或虽然申报但通过填列增值税纳税申报表相关栏次，规避税务机关审核比对，进行虚假申报的。
那么什么是走逃（失联）企业呢？
走逃（失联）企业，是指不履行税收义务并脱离税务机关监管的企业。
税务机关通过实地调查、电话查询、涉税事项办理核查以及其他征管手段，仍对企业和企业相关人员查无下落的，或虽然可以联系到企业代理记账、报税人员等，但其并不知情也不能联系到企业实际控制人的，可以判定该企业为走逃（失联）企业。
企业在取得异常凭证之后也不要慌，一般来说，可以通过以下方式处理。
异常凭证的处理
一般纳税人取得异常凭证，尚未申报抵扣或申报出口退税的，不允许抵扣或办理退税；已经申报抵扣的，应先作进项税额转出；已经办理出口退税的，税务机关可按照异常凭证所涉及的退税额对该企业其他已审核通过的应退税款暂缓办理出口退税，无其他应退税款或应退税款小于涉及退税额的，可由出口企业提供差额部分的担保。
举个例子
甲公司近日接到主管税务机关通知，该从乙公司购入货物取得的5份增值税专用发票为异常凭证，税务机关要求甲公司做进项税额转出处理。
甲公司认为，他们与乙公司的业务是真实的，并且有实际的货物交付、银行凭证等，为什么还要做进项税额转出。
如果甲公司取得的异常凭证作进项额转出后还能继续申请进项抵扣吗？
经核实，异常凭证符合现行增值税进项税额抵扣或出口退税相关规定的，企业可继续申报抵扣，或解除担保并继续办理出口退税。以下两种操作方式，异常凭证可继续申报抵扣或办理出口退税。
（一）接受方向主管税务机关申请核查
甲公司对税务机关认定的异常凭证有异议，可在收到《税务处理事项通知书》之日起20个工作日内，向其主管税务机关提出核查申请，并提交业务合同、银行凭证、运输仓储证明等有关说明材料。
主管税务机关一般应自接收申请之日起90个工作日内完成异常凭证的核实。异常凭证经核实后，未发现异常情形，符合现行增值税进项抵扣或出口退税有关规定的，甲公司凭主管税务机关出具《税务事项通知书》，继续申报抵扣或办理出口退税。
走逃（失联）企业重新与主管税务机关取得联系，履行完毕相关涉税义务、调查澄清相关涉税事项后，纳入税务机关正常监管的，主管税务机关应当解除其走逃（失联）企业身份，同时可解除异常凭证的认定。
假设，案例中乙公司与其主管税务机关联系，履行相关义务事项后，被主管税务机关解除走逃（失联）企业身份。甲公司主管税务机关收到解除异常凭证认定后，向甲公司出具《税务事项通知书》，则甲公司可据此办理申报抵扣或办理出口退税。
未雨绸缪，防范异常凭证
既然可能会出现异常凭证的情况，那么作为企业，最好的办法就是从源头上避免，降低遇到这种情况的概率。
（一）业务真实
在经营活动中，企业取得发票必须要建立在有真实业务发生的基础上。
1、尽量通过银行对公账户将货款划拨到交易对方的银行账户内，并留存银行转账回单。如果对方提供的银行账户与发票上注明的信息不符，应当引起警惕，暂缓付款，对购货业务进行进一步审查。
2、尽量通过正规渠道运输货物，比如物流公司、快递公司，取得正式的物流托运单或者快递单，方便作为货物流环节的第三方证明材料。如果无法取得正规运输凭证，需保留完整、清晰的货物运输过程中的交接环节凭证，比如提货单、出库单、验货单等，并严格要求交接货双方签字盖章。
3、仔细比对发票信息，公司名称、税号、货物名称、规格、数量、金额、银行账号、发票专用章等信息一一比对。尤其是对新供货企业或者临时供货企业（包括网店），更应作重点审查。
（二）查实企业信用等级
为避免发票风险，在合作或业务开始前，通过国家认证的官方机构等查询企业的纳税信用等级等。
1、可以到主管税务机关的门户网站查询纳税人的信用等级、对外公开的纳税黑名单、发票真伪及流向查询等信息。
2、可以到大型平台的公开数据查询企业的信用情况，比如成立时间，企业违规记录等信息。
3、可以在《国家企业信用信息公示系统》，查询企业是否存在异常经营信息。
（三）建立健全的内部财务管理系统
对于企业自身来说，一个健全的财务内控管理系统是保证企业长足发展的重要环节，在取得发票前后及时对各流程及问题进行把控，必要时，也应当要求开票方出具相关证明资料。
同时，企业内部财务人员的整体素质也需要提升。
从这三个方面应对异常凭证，对于企业来说是非常有必要的，提前准备，才能防患于未然，让企业避免一些不必要的税务麻烦。